Quienes gustan de la vida al aire libre encontrarán en esta reserva el hábitat de un gran número de especies de fauna, entre las que destacan jaguar, puma, tapir, manatí, flamenco rosado y tucán. Además da refugio a numerosas aves residentes y migratorias. El área de protección de flora y fauna, de 95,415 has. de superficie, se compone de cenotes y petenes estos últimos influyen en la conservación de los humedales y en la protección de los mantos acuíferos.
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